办公室职责：负责机关日常运转工作。负责会议组织、政务公开、文电、保密、档案、督办查办、人事、财务、机构编制等工作。

党建办职责：负责机关党建、纪检、宣传、工会等工作；承担局党支部工作。

法制科（行政服务科）职责：负责法治、信访稳定、平安建设、政务服务、行政审批等工作；负责农业综合行政执法大队办公室日常工作。

农业一科职责：负责巩固拓展脱贫攻坚成果、农村改革、农村经济等工作；承担区委农村工作领导小组办公室日常工作。

农业二科职责：负责农业生产、农业技术推广、农机、农产品质量安全及农业投入品监管等工作；负责领域内行政执法工作；牵头做好环境污染防治工作及人才工作；承担区农产品质量安全领导小组办公室日常工作；承担区农作物秸秆禁烧和综合利用工作领导小组办公室日常工作。

农业三科职责：负责畜牧兽医管理工作；负责领域内行政执法工作；承担区重大动物疫情防控指挥部办公室日常工作。

水利一科职责：负责水利工程建设及运行管理、水旱灾害防御等工作；负责领域内行政执法工作；牵头做好安全生产工作；承担区河长制办公室日常工作。

水利二科职责：负责水资源管理、节水等工作；负责领域内行政执法工作。

南水北调科职责：负责区南水北调工程运行保障工作；负责南水北调管理所机关事务管理工作。