我国卫生应急工作具有以下主要特点。
　　（1）卫生应急工作的首要目标是预防突发公共卫生事件的发生，尽可能地将突发公共卫生事件控制在萌芽状态或事件发生的初期。当突发公共卫生事件出现后，卫生应急机制应能及时动员相关资源和技术力量，将突发公共卫生事件迅速控制在有限的范围内，减少对公众健康的影响。这就需要我们充分做好日常的卫生应急准备工作，如建立完善预案体系、组建训练有素的综合性卫生应急队伍、建立灵敏的公共卫生信息网络、强化日常卫生应急准备、提高预测预警和快速有效处置能力、促进现场流行病调查和实验室检测能力提高等。
　　（2）卫生应急工作必须符合我国的基本卫生国情，在突发公共卫生事件发生时，能及时有效地调动相关卫生资源、整合各种社会资源、动员全社会参与，及时有效地做好突发公共卫生事件的应急工作。同时，卫生应急工作也必须符合经济全球化的特点，充分借鉴国外卫生应急的理论和实践。做好我国的卫生应急工作是国际卫生应急工作的重要一部分。在2004年底，发生印度洋地震海啸后，我国能在较短的时间内派遣卫生应急队伍到受灾国家，帮助开展救灾防病工作，并提供相关的药品等应急物资援助灾区，这充分显示了我国卫生应急机制建设所取得的成绩。
　　（3）卫生应急机制和体系的建设与完善是一个长期的过程，不可能一蹴而就。一方面要加强监测信息网络、实验室检测、基础建设等硬件建设；另一方面，更要依靠科学，以人为本，加强人员培训和能力建设，发挥专业技术人员在卫生应急工作中的关键作用。
　　（4）依法开展卫生应急工作。《中华人民共和国传染病防治法》和《突发公共卫生事件应急条例》等法律法规的出台，为卫生应急机制的建设和卫生应急工作的开展提供了法律保障。同时，依靠科学、依靠专业队伍、依靠全社会和群众开展卫生应急。